L'agriculture d'aujourd'hui fait face à de nombreux défis : nourrir une population mondiale croissante, réduire la pauvreté et les inégalités, s'adapter au changement climatique, réduire les externalités négatives, conserver les ressources naturelles et diminuer les intrants chimiques. Le nouveau paradigme appelé Agroécologie est une rupture avec l'artificialisation de l'agriculture productiviste qui a intégré la science pendant plus d'un siècle. De nombreuses définitions et approches ont été proposées. Altieri (1995) a défini les principes des systèmes agroécologiques : (i) accroître la diversité génétique et spécifique au niveau de l'exploitation et du paysage, (ii) intégrer les cultures et l'élevage, (iii) s'appuyer sur des sols biologiquement actifs et riches en matière organique, (iv) s'appuyer sur des taux élevés de recyclage de la biomasse et des cycles serrés de nutriments, (v) s'appuyer sur des mécanismes naturels de lutte contre les ravageurs, et (vi) optimiser l'utilisation de l'espace. De nombreux avantages sont attendus à l'échelle de la parcelle et notamment l'augmentation de la production de biomasse, la séquestration du carbone C dans le sol, la fertilité à long terme, la résilience au stress et la résistance aux ravageurs et aux maladies. L'agroécologie est également reconnue comme nécessitant un champ de recherche pluridisciplinaire. Les agriculteurs doivent être impliqués avec les scientifiques dans le développement d'innovations agroécologiques à la fois pour l'hybridation des savoirs locaux et scientifiques et pour la diffusion de futures pratiques améliorées. Par conséquent, les pratiques agroécologiques doivent être fondées sur les connaissances autochtones et scientifiques, être économiquement et écologiquement rationnelles et fondées sur les ressources locales, être socialement et culturellement acceptables et améliorer la productivité agricole. La transition agroécologique est particulièrement importante pour les petits exploitants des régions tropicales où les sociétés rurales et les systèmes alimentaires sont généralement confrontés à de nombreux défis.